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DNA测序将河流变为生态系统监测系统

点击量:   时间:2018-01-02 11:44:05

Jason South Fairfax Media / Getty作者:Conor Gearin湄公河在流入南中国海时充满生机但是,这里发现的独特物种受到沿河建设水电大坝计划的威胁一种新的环境监测技术可以通过仅使用从河中拉出的DNA快速计算上游的所有物种来帮助限制损害该信息可用于在规划阶段影响大坝位置传统的测量方法需要数年才能确定大坝应该避免的生态热点 - 时间开发人员不想浪费 “你不可能用传统的方法对大面积的样本进行抽样,”中国昆明动物研究所的Douglas Yu说 Yu希望通过收集散布在整个环境中的DNA片段并通过DNA测序鉴定它们所属的物种来加速测量他希望与中国生态学家一起在湄公河进行“eDNA调查”,建立一幅稀有和脆弱物种生活的图景这个想法是基于最近的研究,该研究表明,每条河流都是从生活在那里的物种中释放的细胞释放的遗传物质的传送带 - 所谓的环境DNA(eDNA)识别这样的物种 - 就像微生物学家使用DNA测序鉴定样品中的细菌一样 - 可以彻底改变野生动物调查这将使生物学家能够快速检测到生态系统中的许多物种该技术适用于识别水生物种去年,一个欧洲生态学家团队从法国和荷兰的溪流和池塘中取样用于DNA,然后通过广泛的传统调查交叉引用他们的结果他们用眼睛寻找鱼,并在网中捕捉青蛙和火蜥蜴当他们比较结果时,他们发现eDNA在89%的访问地点显示出多种或多种鱼类 “通过我们正在使用的技术,我们获得了所有鱼类,包括非常罕见的鱼类,”法国格勒诺布尔约瑟夫傅立叶大学的皮埃尔·塔伯莱说,他进行了这项测试 “世界充满了DNA收集它并对其进行排序,你可以更好地了解生活“eDNA调查也适用于两栖动物:在每个调查地点,团队通过eDNA发现了许多或更多的两栖动物,就像通过传统调查一样这是因为很多隐藏的物种很难通过眼睛找到它不仅对水居民有用:在河流中发现的eDNA也可以给出陆地栖息生物的图片由纽约伊萨卡康奈尔大学的Kristy Deiner领导的一个小组对来自瑞士Glatt河系八个地点的样本中的eDNA进行了测序他们发现了296个生物系列 - 从水生蠕虫和贝类到生活在格拉特周围土地上的植物和真菌 Taberlet不确定河流eDNA采样是否足以勘测河流流域的所有土地 “你有可能错过很多物种,”他说此外,Deiner的团队仅在家庭层面上识别生物,而不是物种 “在家庭层面进行生物多样性研究,您可以做些什么我认为有一些改进,“他说英国班戈大学的Si Creer说,河流的庞大规模使它们成为环境监测系统的潜力他说:“你几乎可以将河流作为一种生态脉冲来试图找出我们在陆地上所做的事情如何反映在河流的生物多样性中”他还指出,eDNA调查克服了使用分类学家识别所有生态系统物种的问题:没有人的知识是完整的 “即使是一个分类学家团队也只能在他们能够做到的极限范围内看待社区的多样性,”他说 Yu说,eDNA调查可以使资源较少的人更便宜,更快速地进行野生动植物监测 “世界只是渗透着DNA,”他说 “你只需要收集它并以正确的方式对其进行排序,然后你就可以更好地了解生活”这篇文章出现在标题为“DNA of Rivers”的印刷品中更多关于这些主题: